MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Ralstonia solanacearum Po82 megaplasmid

Total Repeats: 46631

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017575	GTA	2	6	142	147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386335009
2	NC_017575	A	6	6	240	245	100 %	0 %	0 %	0 %	386335009
3	NC_017575	GAC	2	6	332	337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386335009
4	NC_017575	ACG	2	6	359	364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386335009
5	NC_017575	CAT	2	6	378	383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386335009
6	NC_017575	G	6	6	393	398	0 %	0 %	100 %	0 %	386335009
7	NC_017575	TGC	2	6	408	413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386335009
8	NC_017575	CGA	2	6	438	443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386335009
9	NC_017575	CCCG	2	8	549	556	0 %	0 %	25 %	75 %	386335009
10	NC_017575	TGA	2	6	587	592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386335009
11	NC_017575	GAA	2	6	738	743	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386335009
12	NC_017575	CCG	2	6	777	782	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386335009
13	NC_017575	CGG	2	6	843	848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386335009
14	NC_017575	CAA	2	6	877	882	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386335009
15	NC_017575	CGATCG	2	12	905	916	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386335009
16	NC_017575	CAA	2	6	936	941	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386335009
17	NC_017575	TCGA	2	8	961	968	25 %	25 %	25 %	25 %	386335009
18	NC_017575	CTG	2	6	982	987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386335009
19	NC_017575	TGG	2	6	1006	1011	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386335009
20	NC_017575	GTG	2	6	1054	1059	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386335009
21	NC_017575	TTC	2	6	1072	1077	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386335009
22	NC_017575	CCGG	2	8	1092	1099	0 %	0 %	50 %	50 %	386335009
23	NC_017575	CTT	2	6	1179	1184	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386335009
24	NC_017575	CGGA	2	8	1198	1205	25 %	0 %	50 %	25 %	386335009
25	NC_017575	AGCG	2	8	1252	1259	25 %	0 %	50 %	25 %	386335009
26	NC_017575	TGG	2	6	1301	1306	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386335009
27	NC_017575	TTC	2	6	1335	1340	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386335009
28	NC_017575	GCC	3	9	1603	1611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386335010
29	NC_017575	TGA	2	6	1620	1625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386335010
30	NC_017575	A	6	6	1688	1693	100 %	0 %	0 %	0 %	386335010
31	NC_017575	A	7	7	1695	1701	100 %	0 %	0 %	0 %	386335010
32	NC_017575	GAC	2	6	1781	1786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386335010
33	NC_017575	CAT	2	6	1795	1800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386335010
34	NC_017575	GAC	2	6	2129	2134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386335011
35	NC_017575	TCG	2	6	2188	2193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386335011
36	NC_017575	GACTAC	2	12	2325	2336	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	386335011
37	NC_017575	GTG	2	6	2340	2345	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386335011
38	NC_017575	C	6	6	2351	2356	0 %	0 %	0 %	100 %	386335011
39	NC_017575	CAT	2	6	2408	2413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386335011
40	NC_017575	GCG	2	6	2445	2450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386335011
41	NC_017575	GCC	2	6	2454	2459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386335011
42	NC_017575	CAG	2	6	2472	2477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386335011
43	NC_017575	TGCGCG	2	12	2500	2511	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386335011
44	NC_017575	GT	3	6	2536	2541	0 %	50 %	50 %	0 %	386335011
45	NC_017575	TGA	2	6	2573	2578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386335011
46	NC_017575	CAT	2	6	2699	2704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386335011
47	NC_017575	GTT	2	6	2723	2728	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386335011
48	NC_017575	GCA	2	6	2729	2734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386335011
49	NC_017575	GA	3	6	2736	2741	50 %	0 %	50 %	0 %	386335011
50	NC_017575	TGC	2	6	2794	2799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386335012
51	NC_017575	GCCC	2	8	2884	2891	0 %	0 %	25 %	75 %	386335012
52	NC_017575	GCG	2	6	2935	2940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386335012
53	NC_017575	CGT	2	6	3010	3015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386335012
54	NC_017575	CAG	2	6	3050	3055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386335012
55	NC_017575	GGC	2	6	3067	3072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386335012
56	NC_017575	AGC	2	6	3225	3230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386335012
57	NC_017575	GAT	2	6	3281	3286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386335012
58	NC_017575	A	7	7	3295	3301	100 %	0 %	0 %	0 %	386335012
59	NC_017575	GAA	2	6	3302	3307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386335012
60	NC_017575	CGG	2	6	3333	3338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386335012
61	NC_017575	CAA	2	6	3346	3351	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386335012
62	NC_017575	GTT	2	6	3361	3366	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386335012
63	NC_017575	TGA	2	6	3393	3398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386335012
64	NC_017575	CGGCAT	2	12	3412	3423	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386335012
65	NC_017575	AAGAC	2	10	3468	3477	60 %	0 %	20 %	20 %	386335012
66	NC_017575	GAA	2	6	3503	3508	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386335012
67	NC_017575	AGTC	2	8	3580	3587	25 %	25 %	25 %	25 %	386335012
68	NC_017575	GAC	2	6	3677	3682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386335012
69	NC_017575	GC	3	6	3689	3694	0 %	0 %	50 %	50 %	386335012
70	NC_017575	TGT	2	6	3744	3749	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386335012
71	NC_017575	CGT	2	6	4184	4189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386335013
72	NC_017575	CGTC	2	8	4198	4205	0 %	25 %	25 %	50 %	386335013
73	NC_017575	CTGG	2	8	4216	4223	0 %	25 %	50 %	25 %	386335013
74	NC_017575	GTC	2	6	4239	4244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386335013
75	NC_017575	GGC	2	6	4301	4306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386335013
76	NC_017575	CG	3	6	4398	4403	0 %	0 %	50 %	50 %	386335013
77	NC_017575	CGG	2	6	4434	4439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386335013
78	NC_017575	ATGG	2	8	4450	4457	25 %	25 %	50 %	0 %	386335013
79	NC_017575	CG	3	6	4507	4512	0 %	0 %	50 %	50 %	386335013
80	NC_017575	GCA	2	6	4624	4629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386335013
81	NC_017575	GCT	2	6	4661	4666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386335013
82	NC_017575	ACG	2	6	4707	4712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386335013
83	NC_017575	CAG	2	6	4721	4726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386335013
84	NC_017575	G	6	6	4830	4835	0 %	0 %	100 %	0 %	386335013
85	NC_017575	CG	3	6	4845	4850	0 %	0 %	50 %	50 %	386335013
86	NC_017575	GGTG	2	8	4851	4858	0 %	25 %	75 %	0 %	386335013
87	NC_017575	CGT	3	9	4863	4871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386335013
88	NC_017575	T	6	6	5174	5179	0 %	100 %	0 %	0 %	386335014
89	NC_017575	AGCC	2	8	5192	5199	25 %	0 %	25 %	50 %	386335014
90	NC_017575	TGC	2	6	5209	5214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386335014
91	NC_017575	GGA	2	6	5249	5254	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386335014
92	NC_017575	GCC	2	6	5256	5261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386335014
93	NC_017575	GGCA	2	8	5264	5271	25 %	0 %	50 %	25 %	386335014
94	NC_017575	GAT	2	6	5279	5284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386335014
95	NC_017575	TCA	2	6	5287	5292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386335014
96	NC_017575	CG	3	6	5307	5312	0 %	0 %	50 %	50 %	386335014
97	NC_017575	GAA	2	6	5363	5368	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386335014
98	NC_017575	GCT	2	6	5378	5383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386335014
99	NC_017575	GTCCA	2	10	5391	5400	20 %	20 %	20 %	40 %	386335014
100	NC_017575	CTGGGC	2	12	5448	5459	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386335014
101	NC_017575	GC	3	6	5473	5478	0 %	0 %	50 %	50 %	386335014
102	NC_017575	CGA	2	6	5492	5497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386335014
103	NC_017575	GCA	2	6	5552	5557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386335014
104	NC_017575	GCT	2	6	5584	5589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386335014
105	NC_017575	TCG	2	6	5593	5598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386335014
106	NC_017575	CGC	2	6	5614	5619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386335014
107	NC_017575	GTG	2	6	5640	5645	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386335014
108	NC_017575	TCG	2	6	5689	5694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386335014
109	NC_017575	CGC	2	6	5755	5760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386335014
110	NC_017575	GCG	2	6	5800	5805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386335014
111	NC_017575	GACG	2	8	5816	5823	25 %	0 %	50 %	25 %	386335014
112	NC_017575	GAG	2	6	5844	5849	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386335014
113	NC_017575	TACCGC	2	12	5862	5873	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	386335014
114	NC_017575	GCA	2	6	5893	5898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386335014
115	NC_017575	GC	4	8	5975	5982	0 %	0 %	50 %	50 %	386335014
116	NC_017575	AGG	2	6	6052	6057	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386335014
117	NC_017575	GGT	2	6	6379	6384	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386335015
118	NC_017575	AAG	2	6	6424	6429	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386335015
119	NC_017575	CGGTT	2	10	6469	6478	0 %	40 %	40 %	20 %	386335015
120	NC_017575	CTT	2	6	6544	6549	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386335015
121	NC_017575	CGG	2	6	6585	6590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386335015
122	NC_017575	CGGT	2	8	6600	6607	0 %	25 %	50 %	25 %	386335015
123	NC_017575	GGCT	2	8	6629	6636	0 %	25 %	50 %	25 %	386335015
124	NC_017575	GCT	2	6	6676	6681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386335015
125	NC_017575	GTCG	2	8	6685	6692	0 %	25 %	50 %	25 %	386335015
126	NC_017575	CCA	2	6	6741	6746	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386335015
127	NC_017575	TGCTGG	2	12	6768	6779	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	386335015
128	NC_017575	CTG	2	6	6785	6790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386335015
129	NC_017575	GTCG	2	8	6799	6806	0 %	25 %	50 %	25 %	386335015
130	NC_017575	GCG	2	6	6807	6812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386335015
131	NC_017575	ACCT	2	8	6830	6837	25 %	25 %	0 %	50 %	386335015
132	NC_017575	GCT	2	6	6925	6930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386335015
133	NC_017575	TGC	2	6	6936	6941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386335015
134	NC_017575	TTC	2	6	6995	7000	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386335015
135	NC_017575	GC	3	6	7014	7019	0 %	0 %	50 %	50 %	386335015
136	NC_017575	GGA	2	6	7048	7053	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386335015
137	NC_017575	CG	3	6	7125	7130	0 %	0 %	50 %	50 %	386335015
138	NC_017575	GGT	2	6	7141	7146	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386335015
139	NC_017575	GGC	2	6	7160	7165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386335015
140	NC_017575	GCT	3	9	7264	7272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386335015
141	NC_017575	GGC	2	6	7298	7303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386335015
142	NC_017575	CGT	2	6	7322	7327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386335015
143	NC_017575	CAT	2	6	7375	7380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386335015
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145	NC_017575	GGC	2	6	7432	7437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386335015
146	NC_017575	GGT	2	6	7474	7479	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386335015
147	NC_017575	GC	3	6	7507	7512	0 %	0 %	50 %	50 %	386335015
148	NC_017575	CGG	2	6	7555	7560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386335015
149	NC_017575	GGCC	2	8	7594	7601	0 %	0 %	50 %	50 %	386335015
150	NC_017575	GCGG	2	8	7767	7774	0 %	0 %	75 %	25 %	386335016
151	NC_017575	CGCTG	2	10	7783	7792	0 %	20 %	40 %	40 %	386335016
152	NC_017575	TGG	2	6	7797	7802	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386335016
153	NC_017575	GCG	3	9	7811	7819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386335016
154	NC_017575	GCA	2	6	7846	7851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386335016
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156	NC_017575	AGA	2	6	7870	7875	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386335016
157	NC_017575	GGCC	2	8	7876	7883	0 %	0 %	50 %	50 %	386335016
158	NC_017575	CAC	2	6	7888	7893	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386335016
159	NC_017575	GC	3	6	7925	7930	0 %	0 %	50 %	50 %	386335016
160	NC_017575	TGC	2	6	7968	7973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386335016
161	NC_017575	CAT	2	6	7994	7999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386335016
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163	NC_017575	GCG	2	6	8016	8021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386335016
164	NC_017575	GAAG	2	8	8038	8045	50 %	0 %	50 %	0 %	386335016
165	NC_017575	CGC	2	6	8053	8058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386335016
166	NC_017575	CCG	2	6	8067	8072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386335016
167	NC_017575	TCC	2	6	8129	8134	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386335016
168	NC_017575	CGC	2	6	8245	8250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386335016
169	NC_017575	TTCG	2	8	8308	8315	0 %	50 %	25 %	25 %	386335016
170	NC_017575	GC	3	6	8327	8332	0 %	0 %	50 %	50 %	386335016
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172	NC_017575	TGC	2	6	8346	8351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386335016
173	NC_017575	GTC	2	6	8380	8385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386335016
174	NC_017575	GCA	2	6	8431	8436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386335016
175	NC_017575	GCGG	2	8	8494	8501	0 %	0 %	75 %	25 %	386335016
176	NC_017575	G	6	6	8500	8505	0 %	0 %	100 %	0 %	386335016
177	NC_017575	CGC	2	6	8529	8534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386335016
178	NC_017575	GATC	2	8	8629	8636	25 %	25 %	25 %	25 %	386335016
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184	NC_017575	GCG	2	6	8840	8845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386335016
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187	NC_017575	CGA	2	6	9040	9045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386335016
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191	NC_017575	GGA	2	6	9160	9165	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386335016
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220	NC_017575	GGCG	2	8	10298	10305	0 %	0 %	75 %	25 %	386335017
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231	NC_017575	TAC	2	6	10551	10556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386335017
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239	NC_017575	ATG	2	6	10692	10697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386335017
240	NC_017575	GCA	2	6	10703	10708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386335017
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242	NC_017575	GAC	2	6	10773	10778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386335017
243	NC_017575	ATG	2	6	10824	10829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386335017
244	NC_017575	CAC	2	6	10841	10846	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386335017
245	NC_017575	GAA	2	6	10851	10856	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386335017
246	NC_017575	GC	3	6	10862	10867	0 %	0 %	50 %	50 %	386335017
247	NC_017575	CTG	2	6	10899	10904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386335017
248	NC_017575	TAGCG	2	10	11082	11091	20 %	20 %	40 %	20 %	386335018
249	NC_017575	GCC	2	6	11111	11116	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386335018
250	NC_017575	CAG	2	6	11127	11132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386335018
251	NC_017575	GCC	2	6	11136	11141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386335018
252	NC_017575	AGC	2	6	11142	11147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386335018
253	NC_017575	CAC	2	6	11177	11182	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386335018
254	NC_017575	GCG	2	6	11211	11216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386335018
255	NC_017575	GCA	2	6	11236	11241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386335018
256	NC_017575	AGC	2	6	11256	11261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386335018
257	NC_017575	CCGCA	2	10	11276	11285	20 %	0 %	20 %	60 %	386335018
258	NC_017575	ACC	2	6	11292	11297	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386335018
259	NC_017575	GCCA	2	8	11355	11362	25 %	0 %	25 %	50 %	386335018
260	NC_017575	AGC	2	6	11379	11384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386335018
261	NC_017575	GGC	2	6	11420	11425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386335018
262	NC_017575	GC	3	6	11429	11434	0 %	0 %	50 %	50 %	386335018
263	NC_017575	CGC	2	6	11443	11448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386335018
264	NC_017575	GGC	2	6	11453	11458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386335018
265	NC_017575	TCTGCG	2	12	11476	11487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386335018
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289	NC_017575	CCGGC	2	10	12432	12441	0 %	0 %	40 %	60 %	386335019
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293	NC_017575	CG	3	6	12474	12479	0 %	0 %	50 %	50 %	386335019
294	NC_017575	GGCG	2	8	12486	12493	0 %	0 %	75 %	25 %	386335019
295	NC_017575	GGC	2	6	12643	12648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386335020
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391	NC_017575	CGG	2	6	15991	15996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386335022
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395	NC_017575	GGC	2	6	16135	16140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386335022
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500	NC_017575	CGC	2	6	19879	19884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386335026

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